Bioinformatik

Beschreibung

• Datenimport
• Datenanalyse und -visualisierung
• Modellierung biologischer Systeme
• Präsentation von Ergebnissen und Anwendungsentwicklung
• Verbesserte Rechenleistung

Datenanalyse und -visualisierung

Daten aus der biologischen Forschung sind nicht nur oft äußerst komplex, sondern stammen auch aus einer Vielzahl verschiedener Quellen und haben darum die unterschiedlichsten Formate oder Eigenschaften. Der Erfolg eines Forschungsprojekts hängt deshalb in entscheidendem Maße davon ab, ob die gewählten Analyse- und Visualisierungs-Werkzeuge ausreichend flexibel und vielseitig ist. Die MATLAB-Produktfamilie beitet dem Anwender eine umfassende Analyseplattform für die Handhabung komplexer Daten und Analysen wie:

• Sequenzanalysen – Die Bioinformatics Toolbox enthält Werkzeuge für Genom- und Proteom-Sequenzanalysen und dabei vorkommende Standardaufgaben, vom Multiple Sequence Alignment (MSA) bis hin zur interaktiven Erzeugung, Darstellung und Manipulation phylogenetischer Stammbäume.
• Microarray-Analysen – Microarray-Daten von Affymetrix-, GenePix- oder ImaGene-Chips können ebenfalls mit derBioinformatics Toolbox analysiert und visualisiert werden.
• Analysen massenspektrometrischer Daten – Mit der Bioinformatics Toolbox lassen sich mit MALDI- oder SELDI-Methoden gewonnene massenspektroskopische Daten aufbereiten und so beispielsweise Biomarker identifizieren.
• Bildgebende biologische Verfahren – Die Image Processing Toolbox enthält eine große Sammlung vorgefertigter, leicht modifizierbarer Bildverarbeitungs-Algorithmen, mit denen sich biologische Aufnahmen und Phänomene analysieren lassen, beispielsweise Bilder zweidimensionaler Gelelektrophoresen oder Aufnahmen zur Bestimmung der Zellmotilität.

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